大肠癌的遗传性
大肠癌的发生与生活方式、环境等多种因素相关，其中遗传因素也是大肠癌发生中极其重要的影响因素。早在1958年，Woolf在对结直肠癌患者家族史的研究中就发现，一级亲属患有大肠癌的人群结直肠癌的死亡率为3.9%，而无家族史的人群为1.2%。随后的大量研究进一步证实，有一个或一个以上一级亲属患结直肠癌者，发生肠癌的危险性比普通人群高2－4倍。纽约纪念肿瘤医院报道，普通人群一生中发生肠癌的累计危险度为4%；而有 一个一级亲属患大肠癌者，发生肠癌的危险度为普通人群的2.3倍；当有一个以上一级亲属患大肠癌时，发生肠癌的危险度达普通人群的4.3倍, 一生中发生肠癌的累计危险度达16%；即便只有一个一级亲属患大肠腺瘤者，发生肠癌的相对危险度也是普通人群的2倍。
此外，患病亲属的发病年龄也是重要的因素。有报道显示，依据亲属中发生肠癌的人数和发病年龄的不同，患结直肠癌的危险性可比普通人群高1.8至8倍。美国的一项研究显示，大肠腺瘤患者的一级亲属发生结直肠癌的相对危险度是普通人群的1.78倍。其中60岁之前患大肠腺瘤者，其一级亲属患肠癌的危险度为普通人群的2.59倍；而60岁之后患大肠腺瘤者，其一级亲属患肠癌的危险度随着患者发病年龄增高而显著降低。
如同散发性大肠癌，任何有家族史的大肠癌通常要经过从腺瘤到癌变的过程，因此随访中纤维肠镜检查、切除大肠息肉是有效的预防手段。多数学者认为，一级亲属患结直肠癌或腺瘤者，应自40岁起定期肠镜检查；若亲属发病年龄早，则应自该亲属发病年龄前3－10年开始定期检查。
家族性腺瘤病
家族性腺瘤病约占大肠癌的1%，由APC基因突变造成。典型的FAP定义为：以遍布整个大肠、数目超过100个以上的腺瘤性息肉和微腺瘤为临床表现的常染色体显性遗传综合征。约60－70％的家族性腺瘤病患者有明确的结直肠癌或息肉家族史，另有30％的患者为没有家族史的新发病例，但无论新发病例还是有家族史的患者，其后代都可能通过遗传而获得突变的APC基因。
FAP患者多十几岁时开始出现腺瘤，如不治疗，至40岁时 100%的患者会转变为结直肠癌。因此一旦诊断为FAP，应当考虑行结肠切除术，以减低发生结直肠癌的风险。一般建议自12岁起每年行肠镜检查；若24岁后仍未发生息肉，肠镜检查可改为每二年一次，直到34岁；然后每3年一次直到44岁。
超过80％的FAP患者上消化道受累。包括胃底腺息肉，可多如地毯样覆盖于胃底，但罕见恶变，胃镜活检明确病理诊断后，通常不需特殊处理；胃窦近幽门腺瘤，属癌前病变，活检证实后应给予完整切除，以防癌变；十二指肠腺瘤，常发生于十二指肠乳头处，易癌变，由于腺瘤有时可以很小而难以发现，因此即便十二指肠乳头外观正常，也应定期对十二指肠乳头以及较大的或疑有癌变的十二指肠息肉进行活检。
FAP患者消化道外病变包括甲状腺癌、腹壁韧带样瘤，或皮肤、骨和眼的非肿瘤性病变如骨瘤病、皮脂囊肿、先天性视网膜色素上皮肥大症等，以韧带样瘤最常见，发生率为4－13％。
遗传性非息肉病性结直肠癌
遗传性非息肉病性结直肠癌（HNPCC）又称Lynch综合症，由错配修复基因缺陷造成，是大肠癌中最常见的常染色体显性遗传的综合症，占结直肠癌的1－6％。具有发病年龄早（平均发病年龄46岁）、近侧大肠癌多见(占70%)、同时或异时多原发大肠癌发生率高（发生率35％）、家族成员肠内外恶性肿瘤，包括结直肠癌、子宫内膜癌、胃癌、泌尿生殖系统和小肠癌等发生率高等特征。依据有无肠外肿瘤，HNPCC分为Lynch I型（无肠外肿瘤）和Lynch II型（有肠外肿瘤）。
HNPCC患者发病较散发性大肠癌早20岁，肿瘤多位于近端结肠；且易发生同时或异时多原发大肠癌。故对HNPCC家族中已患CRC者，多主张行结肠次全切除术，不仅可减少同时和异时大肠癌发生机会，还能简化日后结肠镜检。但对未发生肠癌者是否应行预防性结肠切除术尚有争议，有研究认为虽然行预防性结肠切除术者较定期肠镜检查者平均寿命延长2.1年，但当加入生活质量评估后，定期肠镜检查为预防肠癌的最佳模式。
HNPCC肠外恶性肿瘤包括子宫内膜癌、胃癌、卵巢癌、小肠癌、肝胆系统癌、泌尿系统癌、乳房癌和皮肤肿瘤等发病率高，发生年龄较普通人群早二十年以上，以子宫内膜癌最常见。有学者认为对女性HNPCC患者尤其是已育或已绝经者，应考虑行预防性子宫及附件切除术。
目前HNPCC的临床诊断标准为1998年国际HNPCC合作小组在原Amsterdam标准基础上修改、制定的Amsterdam标准II，内容如下：1. 亲属中三个以上患有病理证实的HNPCC相关肿瘤（包括结直肠癌、子宫内膜癌、小肠癌、输尿管癌/肾盂癌），其中一人为另二人的一级亲属。2.肿瘤累及连续的二代人。3.其中至少一人发病年龄小于50岁。4.除外家族性腺瘤病。Amsterdam标准II提高了部分肠外肿瘤在HNPCC诊断中的价值，但未顾及中国等亚洲国家HNPCC肿瘤的发病状况，可能不完全适合中国HNPCC的诊断需求。因此，建立符合我国HNPCC发病状况的诊断标准已是大肠癌临床工作的迫切需要。
其他较少见的遗传性大肠癌
Turcot综合征是表现为原发性中枢神经系统肿瘤伴有结直肠腺瘤性息肉病的常染色体遗传综合征。发病年龄多为10-20岁，大肠腺瘤数目一般不超过100个；100%的患者将发生腺瘤癌变。部分患者伴有皮肤牛奶咖啡斑。目前认为Turcot综合征中患者部分为FAP的变异型，部分属HNPCC的变异型。
Peutz-Jeghers 综合征是一种较少见的常染色体显性遗传的综合征，由LKB1/STK11基因突变造成，表现为遍布于整个胃肠道的非肿瘤性错构瘤性息肉，伴特征性的口唇、颊粘膜、眼睑和指（趾）等处的色素沉着。息肉通常发生于小肠，结肠、胃相对较少，癌变率2－3%，一般认为只有在息肉出现症状时才需要进行治疗。此外，PJS患者发生各种肠内外肿瘤的风险增加，尤其是一些罕见的生殖系统肿瘤。
幼年性息肉病是常染色体显性遗传的胃肠道上皮具有恶变倾向的综合征，由SMAD4基因突变造成。以累及结直肠、小肠和胃的多发性、错构瘤性息肉为特征，10岁前儿童便血是幼年性息肉病典型的临床症状。患者患大肠癌的累计危险度为9-65%，其他消化道肿瘤的危险性也不同程度增加。约有11-20%的患者伴肠外病变，如：先天性心脏病、先天性肌弛缓、兔唇或颚裂、脑积水等。
Cowden综合征为多发性错构瘤，Bannayan-Ruvalcaba-Riley综合征等
